Московская выдача - это отдельная выдача
По одному и тому же запросу Яндекс показывает разные результаты пользователю из Москвы и пользователю из Новосибирска. Сайт без региона живёт в федеральной выдаче, где стоят агентства с десятилетними доменами и ссылочными бюджетами.
Привязка региона переносит вас в другую конкурентную группу. Это не хитрость и не лазейка, а прямое указание Яндексу, кому вы полезны: московская пекарня не должна конкурировать с пекарней в Екатеринбурге, и Яндекс это понимает.

